二氧化硫煤所含的硫在燃烧时会形成这种气体，若与云中的水分发生反应，即造成酸雨。为了控制硫的排放，许多发电厂会燃烧低硫煤，并让废气通过涤气器来滤除二氧化硫。

　　氮氧化合物发电厂燃烧器的高热会将空气中的氮转化为氮氧化合物，可造成酸雨和地面层臭氧。

　　汞煤中微量的汞会随发电厂排放的废气逸出，再随雨水或雪飘落到数百公里外，在鱼的体内累积，令某些种类的鱼不宜儿童和孕妇食用。

　　二氧化碳与其他化石燃料相比，煤每单位能源所产生的二氧化碳最多。二氧化碳是一种温室气体，会把原本可逸散到外太空的热气圈闭在地球上。目前各电厂都把它释放到大气中。

　　悬浮微粒燃煤发电厂释出的悬浮微粒对心脏和呼吸器官疾病患者有害。煤烟和灰末在排送到烟囱前都会先滤除，但之后硫氧化合物和氮氧化合物还是可能形成更小的悬浮微粒。